Основным шагом к созданию Николо-Прозоровского усадебного комплекса стало строительство в 1792 году Никольского храма. В это время владельцем значился генерал-фельдмаршалл князь Александр Александрович Прозоровский. При нем же был высажен парк и выкопан небольшой пруд. Однако первое упоминание об усадьбе относится к XVI веку. Тогда здесь располагалось село Шипилово и принадлежало князю Василию Семеновичу Серебряному, но в 1585 году опустело.
Главное здание и флигели появились уже к середине XIX века. Манера их исполнения подражала расстрелиевскому барокко. Это было уже при Трубецких. Строения имели украшения в виде лепнины (завитки, вольюты, пальметты и т.д.). Но Николо-Прозорово не имело таких монументальных построек, в отличие от творений Ф. Б. Растрелли.
Начиная с середины XIX века усадьба принадлежала Рабенеку, Сычеву, Кузнецову, Рябушинскому, которые никак не повлияли на архитектурный образ усадьбы, обойдясь лишь незначительными изменениями.
Последние хозяева покинули имение сразу после революции. В главном здании разместился дом отдыха. Уже тогда началось медленное разрушение этого замечательного памятника. В 80-е годы XX века было построено другое здание для санатория, а в самой усадьбе планировалось разместить административную часть. Но с наступлением 90-х деньги, выделенные на строительство и реставрацию, пропали. Практически готовый административный корпус был заморожен и подвергался разграблениям в течении последних 10 лет местным населением.
Если верить некоторым неподтвержденным данным, пруды в парке были выкопаны силами пленных турков, взятых под Измаилом. По другим данным, в церкви при усадьбе венчался сам А.В. Суворов. 16 января 1774 года Александр Васильевич женился на княжне Варваре Ивановне Прозоровской, дочери Ивана Андреевича Прозоровского и Марии Михайловны Голицыной. Качественная и недорогая химчистка диванов у вас дома. Почистим чехлы дивана химией. В москве или московской области. Однако отношения с женой не сложились и в 1784 году великий русский полководец развелся.
Сейчас заброшенное здание санатория облюбовали любители военных игр на открытом воздухе и устраивают там состязания по пейнт-болу. Уже трудно на этой запущенной территории найти те самые 300-летние сосны, некогда являвшиеся одной из главных достопримечательностей в этих местах. Тем не менее, по словам послушниц недавно восстановленного храма, усадьба и прилегающая к ней территория передана настоятелям церкви, которые планируют восстановление усадебного дома.